2008年5月30日金曜日

Gene Ontologyデータベース

gene ontologyデータベースをダウンロードして、ローカルのmysqlに再構築したのは良いけれど、その構造がよくつかめていなかった。
http://www.geneontology.org/images/go-database-ER-diagram.png
ここに、データベースの構造図が載っているが、複雑なデータベース設計なんて見た事無いので、よく理解できなかった。しかし、
http://www.geneontology.org/GO.database.schema.shtml
ここの記述とにらめっこしながら、結合をたどっていくと、何だか少しずつ分かって来たようだ。
はじめは、termテーブルは、GOとその説明だけが登録されていると誤解していたのだが、relationship_type_idの記述などなどもtermテーブルに登録されていたようだ。

0 件のコメント: